甲状腺功能检查结果符合血清TSH轻度升高，而甲状腺激素水平在正常范围，就可以诊断为亚临床甲状腺功能减退症。
在诊断亚临床甲状腺功能减退症之前一定要排除非亚临床甲状腺功能减退症所致的TSH升高，例如临床甲状腺功能减退症患者左甲状腺素替代治疗剂量不足、严重疾患恢复期或者暂时性的TSH升高、破坏性的甲状腺炎恢复期、未经治疗的原发性的肾上腺皮质功能不全、注射TSH、慢性肾病、循环TSH抗体存在以及TSH受体突变而失去活性等，这些都需要在临床上进行有效的甄别。
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