心血管超声检查不会引起疼痛。进行心脏超声检查时，患者需躺在检查床上，婴幼儿需要安静睡着后进行检查。检查时需要暴露探测部位，比如心脏超声检查时，胸口的皮肤要露出来，但是由于仪器使用的要求，超声检查房间的温度控制在20℃-24℃，脱掉衣服会比较凉，所以通常是拉高上衣进行检查，充分显露胸部，建议女士最好不要穿连衣裙。由于大部分的成人心脏位于胸腔中部偏左前方，有肺脏遮掩，所以检查时让患者朝左侧卧，能使心脏贴近胸壁，减少肺部气体干扰，提高心脏图像的清晰度。
在检查部位涂上耦合剂就可以检查。很多人感觉涂在身上的耦合剂，黏黏的不舒服，以为是油，其实耦合剂是以水为溶剂，高分子化合物为溶质，经溶解或溶胀形成的凝胶状物质，主要用于探头与患者之间的超声传导。耦合剂容易擦拭干净，不会污染衣物，探头直接放在胸口心脏的投影区挪动检查，不会产生疼痛感。部分体型比较肥胖的患者，为了获得相对清晰的图像，检查医生会稍加用力深压探头。另外当探头放在上腹部剑突下，从腹部探查心脏时，需要加压才能显示清楚，部分可能会觉得有点不舒服，但都能忍受。
