肛门指检是肛肠科医生最经常使用的一种常规检查方法，这个检查能够确诊很多疾病，操作简单，例如能够检查出直肠恶性肿瘤、混合痔、肛裂、直肠息肉等疾病，还可以判断肛门是否有无狭窄、松弛等严重并发症的出现。同时可以查出内痔、肛瘘，也可以发现肛管外的疾病，例如前列腺疾病、盆腔脓肿或者附件炎、腹腔肿瘤等疾病。
肛门指检还可以查出直肠息肉等良性肿瘤疾病，在检查时通过右手带手套，食指涂抹石蜡于表面观察无血迹或者黏液进行检查。只是一种辅助检查方法，也是一种初级的诊断方式，诊断发现之后需要通过肠镜检查进一步确诊疾病。
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