慢性肾盂肾炎会成为尿毒症，半数以上的慢性肾盂肾炎是由于急性肾盂肾炎反复发生转变而来。由于不断的复发导致肾小管功能受损，逐渐肾小球的功能也出现下降，引起尿毒症。
一般情况下先表现为间断性的尿路刺激征，有尿频、腰部不适，及腰部酸痛，个别会出现低热以及排尿不适等，部分病人表现为无症状性的细菌尿。另外，在肾小管功能受损后表现为夜尿增多，尿比重下降、尿渗透压降低，最终由于肾脏的瘢痕形成，使肾脏的结构发生改变，肾小球受累后引起尿素氮及血肌酐增高、内生肌酐清除率下降、尿毒症的发生。
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