疼痛是肛裂主要的症状，典型肛裂会出现严重的周期性疼痛，疼痛对患者影响较大。有抽搐伴有疼痛感，使患者不能工作。如果是长期肛裂发作状态，疼痛不良体验会使患者恐惧排便，甚至拒绝排便。
因此如果长期出现上述情况，不可避免使患者排便出现改变，肠道也要适应患者具体情况，使肠道排便功能出现改变。肠道大便变稀，出现糊状便或者溏便，很少有成形便。长期反复肛门疼痛会影响到工作状态，难以完成既定工作，甚至不能工作。疼痛也可能使患者对于家庭生活产生影响，比如不能照顾小孩、不能正常整理家务等。因此典型肛裂经过内科治疗，包括药物治疗不能缓解，应该及时手术处理。
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