真菌感染引起的肺炎，临床上称为真菌性肺炎或者侵袭性的肺真菌病，多有发霉的物质接触史，患者有咳嗽、咳痰等症状，有的还伴有刺激性的干咳，重者可以出现呼吸困难、呼吸衰竭，行胸部CT检查，有的有典型的表现，比如半月征或者有空洞。做痰或者肺泡灌洗液涂片检查，可查到真菌的菌丝和孢子，真菌培养可见烟曲霉或者黄曲霉阳性。治疗应用卡泊芬净、伏立康唑等药物进行治疗，治疗周期比较长，需要8-12周。
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