磁共振所产生的是一种电磁波，电磁波对外界有辐射作用，而磁共振产生的这种电磁波的波段非常微弱，对人体是无害的。人们生活的环境有许多电磁波，例如使用的许多家用电器，甚至我们生活的地球都有许多电磁波，这些电磁波虽然有辐射作用，但都不能够对人体造成伤害。磁共振不同于CT等检查设备，因为CT会释放X射线，而X线的电离辐射对人体是有伤害的。
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