肝结节良恶性的判断较为困难，可以进行B超检查，明确肝脏是否存在结节、属于单发还是多发。若存在结节，可以进一步行血清学检查及乙肝检查、肝功能检查、肿瘤学检查，如甲胎蛋白、癌胚抗原等，随后进行CT、磁共振检查，必要时还可以进行超声造影，甚至肝脏结节穿刺。
肝脏结节的良恶性是综合性判断的结果，需要依据病理学检查定性。在CT或磁共振上考虑为肝癌结节的可能性较大时，也需在肝脏穿刺活检或手术切除标本后送病理科观察细胞学形态，从而才能最终判定结节的性质。
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