肝囊肿的治疗主要是根据肝囊肿的数量、大小、部位等因素综合考虑。如果囊肿是单发，比较小，可以不做特殊处理。如果囊肿＞10cm，明显的压迫邻近的脏器，如压迫胃、压迫结肠，可以在超声引导下做穿刺，把囊肿抽出来后，囊肿内注射无水酒精，破坏囊壁，也可以腹腔镜下做囊肿的开创引流；如果为多囊肝，同时合并多囊肾，多囊肝仅仅局限在一叶，有明显的占位效应，可以做开腹的肝脏的局部切除；如果是非常严重的多囊肝、多囊肾，囊肿遍布全肝，严重影响肝脏功能，只能做肝移植。
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