肛瘘和痔疮是两种不同的疾病。而肛瘘这种疾病主要是继发于肛窦的炎症，或者肛周脓肿没有得到及时有效的治疗，以及肛周脓肿手术之后遗留所导致的。病人会表现为肛周的潮湿，有分泌物以及异味，最有效的治疗办法是进行手术，并且应该早期的选择手术治疗，因为简单性的肛瘘，如果延误治疗时机会转变为复杂性的肛瘘，治疗起来会非常麻烦。而痔疮主要是由于直肠或者肛管局部形成曲张的静脉团，甚至有血栓形成。病人会表现为肛周疼痛、排便带血，严重的情况下还会出现发热，最有效的治疗办法也是选择手术，将痔疮切除。
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