头颅CT检查颅内血肿、脑外伤、脑出血、蛛网膜下腔出血、脑梗死、脑肿瘤、脑积水、脑萎缩、脑炎症性疾病以及脑寄生虫病、脑发育畸形等疾病。
CT可清晰地显示不同平面的脑实质、脑室和脑池的形态、位置等图像，头颅CT用于检查脑出血，优于头颅核磁共振，但头颅CT对于早期的脑梗死检查不如核磁共振。头颅CT还可给予血管造影检查，即静脉注射造影剂后，经计算机对图像进行处理，可以三维显示颅内血管系统。
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