肛瘘包括外口、内口和窦道，肛瘘可有肛门周围流脓，肛门周围肿痛等症状。有时肛周皮肤外口处，可流出少量的脓液，肛周周围可见炎性肿块，可以伴瘙痒等临床症状。自外口流出脓液，常常刺激瘘口周围的皮肤，使肛门皮肤瘙痒和湿疹。还有一些肛瘘伴有排便困难，有的还伴有贫血，导致身体消瘦、精神萎靡等症状，比如克罗恩病肛瘘患者，这种体质比较差，恶病体质，神经衰弱，精神萎靡比较严重。
