男性尿痛常见原因是由于泌尿系统感染，尤其是下尿路感染所导致。下尿路的感染，男性常见于尿道炎、列腺炎以及膀胱炎等，下尿路感染控制不佳也可以逆行引起上尿路的感染。下尿路的感染，如尿道炎，通常分为淋菌性尿道炎或非淋菌性尿道炎，而前列腺炎通常分为急性细菌性前列腺炎、慢性无菌性前列腺炎、慢性前列腺炎盆腔疼痛综合征和无症状型前列腺炎，上尿路感染通常以肾盂肾炎为多见。
对于男性尿痛，如果由于感染造成，通常是应用抗感染治疗，也就是采用抗生素进行治疗。抗生素的选择种类比较多，包括喹诺酮类、头孢类、青霉素类以及红霉素类，都可以用于临床抗感染治疗，根据药敏结果选用药物比较符合临床使用药物的特点。而对于其它的原因，如泌尿系统结石、肿瘤、结核、损伤、异物等引起的尿痛，也可以根据病情采用相应的治疗方案。
