扁桃体肥大如果没有特殊的临床手术指征，原则上不需要特殊处理，尤其是青春期之前的扁桃体肥大。如果伴随有反复的扁桃体发炎或者扁桃体肥大，导致睡眠时打鼾，伴随有憋气的情况，一般建议手术治疗。但青春期之前，如果能保守，尽量保守治疗，因为免疫机制并没有完全的形成，大部分是指着扁桃体等免疫组织或者器官杀病毒及细菌。而青春期之后的扁桃体肥大，主要治疗方法也是在发炎时吃头孢类的抗生素。发炎如果太过频繁，还是建议手术切除。
