肾脏结石如果导致单侧肾脏出现萎缩，需要进一步评估单侧肾脏功能来决定如何处理。1、如果进行肾脏功能评测，单侧肾脏的GFR，也就是肾小球滤过率小于10%，建议进行肾切除手术治疗。连同萎缩的肾脏和结石一并进行切除，以免结石停留造成肾脏疾病的恶化，比如产生肾盂肿瘤或者造成反复出血、感染等。2、如果肾脏的GFR，也就是肾小球滤过率大于10%以上，建议进行手术取石。可以通过经皮肾镜或者输尿管镜等方式，使用激光来将结石击碎取出，祛除引起萎缩的致病因素以后留置输尿管支架管，动态复查肾功能的变化情况。对于已经造成的肾实质损害，其无恢复的可能性。但是祛除病因以后，可以防止肾脏进一步的发生萎缩或者肾实质的破坏。能够挽留部分的肾功能，维持机体的健康。
