晨起口苦主要考虑两个方面的原因：一、幽门螺杆菌感染，患者需要完善碳13或者碳14尿素呼气试验，进行幽门螺杆菌的检测，如果数值是阳性的，证明有幽门螺杆菌感染，需要正规根除幽门螺杆菌治疗。二、是否有胆汁反流，也就是胆汁反流性胃炎，需要患者进一步完善电子胃镜检查明确诊断。如果在镜下看到黏液湖含有胆汁或者胃壁有胆汁附着，可以明确诊断胆汁反流。治疗方面主要给予抑制胃酸、促进胃动力、吸附胆汁等相关治疗。
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