发热后头疼的原因最常见是因为细菌、病毒或非典型性病原体感染人体后导致炎症介质释放。而炎症介质释放的时候会通过血脑屏障，影响脑血管的神经节，出现血管神经水肿性头痛，此时还会侵犯脑神经根，导致神经异常放电的情况。发热时由于患者脱水，体温的变化还会导致颅内压的改变，如病毒感染时还会引发病毒性脑炎，会更加加重头痛。最后还有患者因为神经体液内分泌系统受影响出现精神紧张性头痛。因此临床上处理发烧的时候都可应用解热镇痛药，解热镇痛药对头疼是有一定缓解效果的。
