经肛门前列腺插管微波治疗，在治慢性前列腺炎的治疗中具有一定的作用。慢性前列腺炎病因复杂，病情往往迁延不愈，而且容易复发，严重影响患者的生活质量。由于前列腺外层内脂膜药物不易穿透，通常口服药在前列腺组织腺泡和分泌物中很难达到有效的治疗浓度。而微波治疗是可以直接作用于患处的治疗方式，使能量进入组织内，使组织内的细胞极性分子处于激励状态，发生高频震荡与相连分子通过摩擦，可将微波能转变成热能，使局部的毛细血管扩张、通透性增强，从而达到缓解前列腺症状的治疗目的。
经肛门前列腺微波治疗，多数病人在治疗一个疗程后，主观症状如尿急、尿频、排尿费力、夜尿增多，以及腰骶、阴囊、会阴胀痛不适等，逐步开始缓解，部分患者在三个月后主观症状进一步缓解。因此微波治疗可用于各类慢性非细菌性前列腺炎经肛门治疗，治疗中维持前列腺的温度在41-42℃，每次治疗时间大约半小时，但禁止用于装有心脏起搏器患者。另外前列腺炎的治疗综合治疗是关键，治疗过程中要避免久坐，禁止食用辛辣刺激性食物，避免着凉，避免长期骑自行车等。
