奥利司他的副作用即不良反应的症状主要为胃肠道的不良反应，主要原因是奥利司他能够阻止脂肪吸收，所以常见的不良反应为油性的斑点、胃肠排气增多、大便的紧急感、脂肪性大便、油性的大便或脂肪泻等，同时伴随大便次数增多、大便失禁，如果膳食中脂肪成分增加较多，不良反应发生的概率也会明显增高。此时可以通过食用低脂的膳食相应地减少上述不良反应发生的症状。
在观测奥利司他的不良反应时，尤其是观测奥利司他的胃肠道不良反应，主要是根据服用后的不良反应的症状自行检测。摄入的食物中脂肪的含量是否合适，比如胃肠道不良反应的症状较明显，就可以适当减少摄入食物中的脂肪，而且服用奥利司他后产生的胃肠道不良反应通常症状较轻，且在治疗期间的前3个月出现较多。
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