基因检测阴性但是是癌，一般指基因检测阴性而病理确认是癌的情况，这时仍然可以采用多种治疗手段进行治疗，比如对于早期的癌，没有淋巴结转移，也没有远处器官转移的情况下，可以进行根治性的手术切除，术后还可以辅助化疗。通过手术和术后化疗的综合应用，可以延缓术后复发现象的发生，延长病人的生存期。即使患有癌的病人已经伴有了淋巴结的转移，或者伴有了远处器官的转移，不适合进行根治性手术治疗，也可以采用化疗、放疗、免疫治疗等综合的治疗手段，来控制病情的发展，减轻病人的痛苦，并且延长其生存期。
还有一些癌虽然基因检测结果是阴性，但是仍然有机会接受抗血管生成类的靶向药物治疗，比如非小细胞肺癌的病人，可以根据病情的需要，选用抗血管生成的靶向药物联合化疗进行综合治疗，也能获得比较好的治疗效果。
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