肛门半夜突然胀痛主要考虑痔疮、肛周脓肿以及肛窦炎等引起。最常见的原因是痔疮，痔疮症状的出现主要由于肛门周围形成静脉曲张所引起，特别是发生于肛管齿状线之上的内痔。由于痔核的出现，对直肠末端黏膜造成刺激，因而出现肛门部位的胀痛症状。肛周脓肿也会导致肛门周围出现胀痛的症状。直肠末端由于细菌或粪便的长期刺激，出现急性炎症性病变，当脓液从肛门周围形成的瘘道渗出后，就会在肛门周围形成脓肿或肿块，进而引起坠胀感以及疼痛感。细菌感染造成的肛窦发炎，在形成肛窦炎时也会导致肛门胀痛症状的出现。
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