偏头痛的病因目前还不明确，可能和以下因素有关：
1、遗传易感性，大约60%的偏头痛患者有家族史，亲属出现偏头痛的风险是一般人群的3-6倍，比如家族性偏瘫性偏头痛，呈高度外显率的常染色体显性遗传，和多种基因突变有关。
2、内分泌和代谢因素，可能也参与偏头痛的发病，因为本病女性多于男性，多在青春期发病，月经期容易发作，妊娠期或绝经后发作减少或停止。
3、环境因素也参与偏头痛的发作，还可能有某些食物和药物所诱发，食物包括含酪胺的奶酪，含亚硝酸盐的肉类和腌制食品，含苯乙胺的巧克力，含谷氨酸钠的食品添加剂以及葡萄酒等，药物包括口服避孕药和血管扩张剂，比如硝酸甘油等。
4、强光、过度疲劳、应激以及应激后的放松、睡眠过度或减少、饥饿、紧张、情绪不稳等，也是偏头痛的诱发因素。
