隐睾手术后睾丸萎缩，主要有以下几种可能：
1、手术中可能损伤睾丸动脉，睾丸的供血不好，导致隐睾手术后睾丸出现萎缩。
2、隐睾固定的地方太紧，导致精索受压，引起动脉供血不好，导致睾丸萎缩。
3、隐睾自身的问题，睾丸长时间在腹膜后，没有正常的发育，下降到阴囊后，睾丸的发育受到障碍，所以，出现萎缩。
4、隐睾非常小，就会导致萎缩，没有有效的正常睾丸组织。对于隐睾萎缩，一定要监测雄性激素水平，必要时候可以用药物治疗。
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