甲状腺功能五项通常包括总T3、总T4、游离T3和游离T4以及TSH，通常这五项如果T3、T4水平升高，同时伴有TSH水平下降。这种情况考虑原发性的甲亢，也就是病变部位在甲状腺本身所导致的甲状腺功能亢进。
如果T3、T4水平升高TSH也升高，这种情况通常考虑是中枢性的甲亢病变部位在下丘脑垂体，如果是T3、T4降低，同时伴有TSH的升高，通常考虑原发性的甲减病变部位在甲状腺本身，如果T3、T4降低同时伴有TSH的水平的降低，这种情况通常考虑中枢性的甲减病变部位在下丘脑垂体。
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