排尿的时候尿道会疼痛，可能的原因有，1、急性尿道炎，可以造成尿道黏膜充血、水肿、糜烂等改变，排尿时会出现尿道内疼痛的症状，并且同时伴有尿频、尿急或者小便带血等症状，需要进行尿常规进一步检查确诊。2、如果尿道内存在有结石、息肉、肿瘤等病变，可以在排尿过程中出现局部的刺痛感，如结石或者息肉肿瘤造成尿路完全梗阻，除外疼痛还伴有排尿费力、分叉或者无法排尿的情况，需要进行尿道镜检查进一步明确原因。3、如果存在有外生殖器或者尿道部位的损伤，可以出现排尿时疼痛感。损伤包括直接的暴力打击或者合并有骨盆骨折等，可以造成局部黏膜的撕脱或者撕裂，造成排尿时疼痛，同时可伴有尿道口出血，或者相关功能脏器的损伤等。
