按照泌尿外科手术分类标准，经皮肾镜手术属于四级手术，属于较大手术。由于微创器械进步，还有手术医生经验的积累，经皮肾镜目前已经成为泌尿外科非常经典的成熟手术方式，一般用来解决在肾内结石负荷比较大，通俗的理解为结石体积比较大或者结石位于肾盏等用软镜难以处理的部位。
经皮肾镜手术一般在B超或者X线引导下，在肾盏先穿刺一个点，必要时需要做辅助穿刺。通过体表的穿刺点置入观察镜，以及能量器械治疗结石。在术后一般会留置造瘘管，同时还会留置输尿管支架管，也是为了方便碎石的排出、预防输尿管的狭窄。一般在术后1-2天，肾周边的造瘘管可以拔除，术后2-4周输尿管的支架管也可以拔除。
