肾脏结石手术一般不会引起慢性肾功能衰竭，除非是手术的时机已经比较晚，已经出现了肾功能的损害。这样手术的过程中可能会造成部分肾实质的损害，而导致肾功能逐渐出现慢性衰竭等。这些病变的前提是因为结石已经对肾脏产生了不可逆的损害，比如大量的肾积水，或者存在有肾皮质变薄等情况。这样即便进行结石清除手术后，已经损害的肾功能不能恢复，随着年龄的增长，或者伴有其他内科性的疾病，肾功能会逐渐出现缓慢的衰竭的情况。但是如果手术的时机合适，肾功能没有产生明显的损害，则及时的手术可以避免发生肾功能衰竭的情况，而手术本身不会导致肾功能衰竭。所以对于存在有肾结石的患者，到医院及时采用合适的检查及其合适的治疗方式，以免发生不可逆的肾功能损害。
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