病原体，是指造成机体致病的寄生虫和微生物的统称，其中微生物占绝大多数，包括细菌病毒、立克次体、支原体、衣原体、真菌等。病原体广泛存在于自然界中，有些寄生于人体中，有些在自然界中存在。病原体可能为正常的菌群也可能会致病，如肠道菌群是正常菌群。但如果机体遭到病原体侵袭、毒力较强，且免疫力低下时就可导致机体感染，如细菌感染、病毒感染、真菌感染等。可根据痰培养、血培养以及体液培养，得出病原体的种类，从而根据结果进行相应治疗。
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