泌尿系统结核最早受到的感染部位是肾脏，此时结核菌通过血液进入肾脏的皮质之内，产生病理性结核，但此时并不并发有临床症状。患者可无任何自觉症状，随着机体免疫力进一步下降或者出现有结核菌进一步繁殖，可以造成肾脏皮质脓肿、肾脏实质破坏。结核菌可以破溃，通过肾盂排入输尿管和膀胱尿道之内，这时出现膀胱挛缩，病人表现为尿频、尿急或者伴有脓尿的症状。随着膀胱结核进一步进展，这时可以出现症状，称之为临床性结核。膀胱结核进一步的挛缩会造成输尿管狭窄，可以造成肾脏积水，而表现为这一侧肾脏完全积水或者肾功能丧失。结核菌还可以通过血液循环进入附睾中，称之为附睾结核，属于泌尿系统的终末结核。
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