蛔虫的危害，可分为幼虫期和成虫期两部分。
蛔虫的幼虫经肠道吸收后，可以随血循环进入肺内，引起畏寒、发热、咳嗽、痰中带血，以及荨麻疹等过敏性肺炎症状，重度感染时幼虫可透过肺毛细血管，进入大循环，侵入甲状腺、淋巴结、胸腺、脾脏、脑、脊髓，继而引起相应部位的症状。
蛔虫的成虫寄生在肠道，可出现恶心、呕吐、腹胀腹痛，食欲减退，间歇性脐周疼痛或上腹部绞痛。儿童还可以出现惊厥、磨牙、异食症，继而会影响儿童的生长发育。
蛔虫还会引起一些严重的并发症，例如蛔虫性肠梗阻、胆道蛔虫病、阑尾蛔虫病甚至可以造成肠穿孔。
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