脑垂体手术后遗症主要包括有：
1、尿崩症，如果囊肿位于垂体部位，在进行手术操作时有可能损伤到垂体柄，如果损伤到垂体柄，就有可能会引起尿崩症，但是对于尿崩症的患者大多数能够治愈，只有极少数患者会遗留有永久性尿崩症。
2、脑脊液漏，主要是由于手术过程中损伤到硬脑膜，从而使脑脊液从耳朵和鼻腔流出。
3、颅内感染，因为脑囊肿手术是属于开颅手术，进行颅内操作的手术，均有可能会发生颅内感染。
4、癫痫，进行过开颅手术之后，由于脑组织形成瘢痕，导致脑的异常放电，从而引起癫痫发生。
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