脐血穿刺比羊水穿刺的风险高，脐血穿刺通常在羊水穿刺不能代替的情况下选择，如对胎儿进行宫内输血，或是孕周过大已经错过羊水穿刺的时机，以及需对小孩进行血型鉴定等。
脐血穿刺有利有弊，一方面能及时准确的了解胎儿，抽胎儿自身的血很直观。另一个方面因为脐带漂浮于羊水中，经脐血穿刺后，穿刺点若止血效果不佳可能会导致血肿，甚至脐血丢失，导致胎儿贫血等。
目前，可以做羊水穿刺的孕周较之前的时间更长，从十六周开始，一直到二十几周，取代了部分脐血穿刺。
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