颈动脉海绵窦瘘的后果最严重的是脑梗死的发生。正常的人体，动脉经过脑组织相应的代谢，流入到静脉，再从静脉回流到心脏。但是如果出现了颈动脉海绵窦瘘，在初始端的时候，动脉血就直接流入到了静脉，从而使远端产生供血不足的表现。如果瘘口非常大，动脉血全部流入到了静脉，就可能会造成远端缺血的表现而形成脑梗死。甚至有的可能会形成大面积脑梗死，只有通过开颅去骨瓣减压手术才能够挽救患者的生命，这个是最为严重的后果。还有其他的后果，包括突眼等。这个主要是因为静脉窦内有一个眼静脉，当眼静脉因为动脉血的作用压力急剧升高，就会表现出回流的障碍，从而压迫眼球，造成眼球向外突出的表现。如果时间过长，眼睑无法闭合，会造成视力下降、暴露性角膜炎等各种情况的产生。但是，这些情况都可以随着积极治疗而有一个相对比较好的预后。
