霉菌性阴道炎没有根治的方法，因为霉菌是正常存在于女性阴道当中的生理性菌群，每个女性阴道当中都有霉菌，跟细菌以及其他病原体形成微生态平衡，这个平衡不被打破，保持平衡状态就不会发作炎症。如果因为各种内部、外部因素作用，破坏阴道环境，比如性生活、各种原因导致局部抵抗力下降，都会使得阴道内正常的细菌菌落发生破坏，如乳酸杆菌大量消耗，这种情况下霉菌繁殖，形成霉菌性阴道炎。
发作之后的治疗是将多出来的霉菌治愈，而不是把所有霉菌都杀死，因此霉菌是得不到根治的，也就说没有治好、永远不复发这个概念。霉菌的预防复发主要靠提高免疫力，包括局部和全身的免疫力，以及减少性生活频率，降低霉菌复发率，不存在根治的概念。
