导致尿道下裂的原因有很多：
1、与患儿的父亲有关。如果患儿的父亲是个尿道下裂的患者，则下一代如果是男孩的，得尿道下裂的可能性大概会有20%。
2、与患儿的母亲有关。在母亲怀孕的初期，如果使用过孕激素或者雌激素，则容易生下有尿道下裂的患儿，比如在生产雌激素工厂工作的女工，常会生育下有尿道下裂的患儿。
3、患儿本身如果双氢睾酮比较低，也容易得尿道下裂，比如除草剂会竞争双氢睾酮依赖性基因表达，则所有接触过除草剂的人，也容易产下尿道下裂的胎儿。
4、周围环境的污染以及母亲不良生活习惯导致的，比如吸烟的孕妇、酗酒的孕妇生下尿道下裂的患儿可能性比较大。
