有一部分RNA病毒是有疫苗可以预防的，常见的RNA病毒有艾滋病病毒、丙肝病毒、乙型脑炎病毒、流感病毒、鼻病毒、脊髓灰质炎病毒、轮状病毒、SARS病毒、MERS病毒、埃博拉病毒以及最近的新型冠状病毒。脊髓灰质炎、肠道病毒、甲肝病毒、艾滋病病毒、流感病毒目前都是有预防的疫苗效果很好，可以控制流行病的发生。但是总的因为RNA病毒容易突变并且变异很快，RNA病毒的疫苗研制是很困难的，即使某天研制出RNA病毒疫苗，有可能每年还是会出现新变异的病毒，需要不断研制新的疫苗，疫苗接种仍然是目前对抗RNA病毒最有效的方法。
