结肠镜下进行息肉切除手术，麻醉情况下不会疼痛，因为黏膜本身通过高频电流切割以后，时间较短。但是肠镜本身如果在非麻醉状态下，会因为镜子推送引起疼痛。
因此，临床中通常建议肠镜下息肉摘除最好在无痛麻醉状态下进行操作。静脉麻醉时处于较浅昏睡状态，感觉较为迟钝，没有痛感。在此状态下进行有创操作，可在20-30分钟内完成手术，过程当中完全没有感觉，即没有痛苦。
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