呼吸外科在临床上并不是常见的命名的科室，主要是胸外科比较多见，胸外科里面有关于肺脏的疾病需要进行相应的外科治疗。一般呼吸外科主要是针对于肺部的占位性病变，比如畸胎瘤、错构瘤，瘤体比较大或者病变的良性瘤体比较多，对肺组织造成压迫影响肺功能。另外就是威胁生命安全的恶性肿瘤，比如支气管肺癌、肺泡细胞癌等，这些情况需要进行相应的手术治疗，比如手术切除等，必要时还要根据肺部的情况做相应的整形、修复等，保持尽可能正常的肺功能。
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