闭经除一部分是因为性发育迟缓导致的，更多的是由于性器官发育畸形所引起。常见的有以下几种情况：第一、子宫发育异常，子宫内膜是经血的发源地，有些女性先天性的发育异常或子宫发育不良，不经过治疗是不可能出现月经的。第二、阴道即处女膜的发育异常，常见的有先天性无阴道、阴道横隔和处女膜闭锁这三种情况。第三、先天性卵巢缺失或发育不良，维持月经的重要条件是卵巢所分泌的激素和卵巢的排卵功能。如果没有卵巢或卵巢功能发育不全，女性激素没有来源，就会没有月经，同时女性第二性征的发育也会停滞。第四、下丘脑-垂体-卵巢轴功能的紊乱，主要原因是精神因素，比如突然遭受巨大的打击、环境影响，都会影响月经来潮。
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