输精管疼痛多数是由于炎症所致，一部分人可能是因为结核或者是肿瘤，最常见是由于前列腺炎控制不好，而病原体逆行顺着精道进入到精囊、输精管，甚至到附睾、睾丸，引起精道的逆行感染。
临床上常见的病原体包括细菌、支原体、衣原体等，炎症明显时可以一侧或者双侧输精管疼痛，伴有射精痛，甚至可以出现血精。治疗的方法通常是抗菌治疗，例如常用的有阿奇霉素、头孢菌素、左氧氟沙星等。治疗期间注意不要饮酒，不要吃辛辣、刺激食物。不过通常在治疗之前，还是应该做全面的检查，以排除结核和肿瘤，然后再按照炎症治疗，以免遗漏比较危险的疾病。
