下咽癌的发病原因到目前为止也不是很清楚。一般来说，认为最主要的原因与这几方面有关：第一个跟吸烟有关，第二个跟饮酒有关，第三个跟病毒感染有关，就是人类乳头状瘤病毒感染有关，第四个跟食道反流有关。因为有一部分病人下咽癌可以合并食管癌，所以跟食管癌的病因有相似、重叠的部分。也有一些是说饮食方面的原因，比如说长期吃辛辣刺激的、吃烫的食物等等，这些都有一定的关系。
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