肌酸激酶同工酶的升高，临床意义是非常重要的，远远高于肌酸激酶本身的升高。肌酸激酶同工酶可以分为肌肉型、脑型、杂化型和线粒体型。在心脏方面，经常检测的就是杂化型的肌酸激酶同工酶，也就是CK-MB。当出现肌酸激酶同工酶的升高时，最常考虑的疾病包括急性心肌梗死、甲状腺功能减低症、脑血管疾病、肺部疾病、慢性醇中毒或者手术后的肌肉挛缩、心脏复苏后、休克等等这一类的疾病。对于CK-MB，最为重要的就是有可能会出现心肌梗死和心肌的损伤，当出现肌酸激酶同工酶升高的时候，特别重要的是一定要找到病因。
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