肚子里咕噜叫是由于肠道蠕动较快造成的，因为腹泻主要是病毒、细菌、寄生虫以及肠道菌群失调导致的，上述致病源导致肠道的黏膜充血、水肿以及大量炎性细胞浸润，导致肠道内的液体增多。病原体以及炎性细胞刺激导致肠道黏膜损伤，肠道蠕动加快，出现肚子里咕噜叫，可伴有大便次数增多，部分患者可出现腹痛，排便后腹痛可缓解。肠道菌群失调，由于肠道内的有害菌群成为优势菌群，有害菌群的作用下，也可导致肠道黏膜的炎性细胞浸润，肠道蠕动加快，出现肚子里咕噜叫。
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