打完HPV疫苗以后的不良反应包括全身反应和局部的不良反应，具体如下：
1、全身不良反应十分常见的有疲乏、头痛、肌肉酸痛，比较常见的全身不良反应有发热、胃肠道反应、关节疼痛、瘙痒、皮疹和荨麻疹。比较少见的全身反应有偶发的上呼吸道感染、头晕、局部感觉异常以及淋巴结病。
2、打完HPV疫苗以后，也有可能会出现局部的不良反应，十分常见的局部不良反应有注射部位的疼痛、发红和肿胀，比较少见、偶发的局部不良反应有注射部位的硬结等。
和四价疫苗相比较，九价疫苗局部不良反应的发生率增高，但是全身性的不良反应，四价疫苗、九价疫苗和二价疫苗发生率基本相同。目前在所有临床试验中，均没有发现任何与疫苗有关的死亡病例。
