疱疹性咽颊炎和手足口病是由不同的病毒引起的呼吸道疾病，疱疹性咽颊炎主要是由柯萨奇A组病毒引起，疱疹主要集中在咽后壁、颚弓、扁桃体部位，一般不累及到口腔前半部，手心、脚心、肛周也不会出现疱疹，没有并发症预后良好，1周左右可以痊愈。手足口病是由肠道病毒71型和柯萨奇A16病毒引起的，具有很强的传染性，属于传染性疾病。它在咽喉后壁出现疱疹的同时手心、脚心以及肛周的皮肤也出现疱疹，严重者全身都可以出现疱疹，症状较重容易合并脑炎、心肌炎等。
