甲亢、甲减有一定的遗传性，但不是所有甲亢、甲减都是由遗传而导致，遗传只是其中的一个诱因。如甲亢的患者，有研究显示1/4-1/5的甲亢患者中，其近亲也患过甲亢，相同的生活环境和遗传背景与其家族性可能有关。
另外，在妊娠期患Graves病的母亲，母亲的促甲状腺激素受体抗体可以通过胎盘进入到胎儿体内，会导致新生儿甲亢。而在一级亲属有自身免疫性甲状腺疾病等患者中，患甲减的风险明显增加，自身免疫性甲状腺炎又是甲减最常见的原因。
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