宝宝耳朵流黄水，并且有臭味，应根据患儿的情况判断原因，具体如下：
1、如果是双侧外耳道都有，考虑是外耳道油性耵聍引起的可能，外耳道软骨部有耵聍腺和汗腺及皮脂腺，耵聍腺每天都可以分泌耵聍，耵聍有油状耵聍，也有干性耵聍，耵聍性质和民族种类有关，也和遗传关系很大，中国人的耵聍以干性耵聍为主，如果是干性耵聍，一般外耳道不会有流黄水样物；
2、如果是一侧耳朵流黄脓状物，考虑是急性化脓性中耳炎引起的可能，如是急性化脓性中耳炎，需要尽快进行抗生素治疗。
具体情况需要到耳鼻咽喉科就诊，得到明确诊断。
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