小儿肠梗阻的原因有很多种：
1、先天性原因，像先天性肥厚性幽门狭窄、先天性十二指肠膜状闭锁、十二指肠狭窄或者闭锁、环状胰腺、先天性肠旋转不良、小肠闭锁等，这些疾病都是先天性的，属于上消化道梗阻，出现的呕吐症状比较早，腹胀不是很明显，一般都需要尽快手术治疗，先天性巨结肠是比较常见的低位肠梗阻，也是先天性原因，表现为反复的腹胀、便秘，属于不完全性肠梗阻。
2、后天性因素，最常见的发生在4-24个月之间的小儿肠梗阻是肠套叠，这是部分小肠套入结肠引起的肠梗阻，还有粘连性肠梗阻，通常患儿有手术史，术后腹腔内粘连引起粘连性肠梗阻，还有比较少见的如粪石引起的肠梗阻。
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