百多邦和红霉素软膏比起来，百多邦更优，百多邦的抗菌谱比较广，对于皮肤软组织的感染，常见的能够引起皮肤软组织感染的菌，包括葡萄球菌链球菌，甚至是耐药的细菌感染，百多邦都有比较好的杀菌效果。红霉素的抗菌谱比较窄，主要是对于革兰氏阳性球菌和杆菌效果好，但是抑制细菌的种类不如百多邦更广。
另外百多邦对于组织的渗透性更强，也就是同样涂百多邦和红霉素的情况下，百多邦渗到皮下组织达到的深度更深，也就是能够控制更深部位的感染。红霉素软膏外用，这种外用抗生素的方法可以导致身体对抗生素的耐药，也就是外用红霉素一段时间以后，身体有可能对以后口服红霉素，也会有耐药情况发生。但是百多邦只有外用药而没有口服药的剂型，所以不会诱发出身体对于抗菌素的耐药性。综合以上三点，百多邦要更优于红霉素软膏。
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