新生儿肠道感染的症状可以表现为呕吐、腹泻、腹胀以及发热或者是体温不升。有时候新生儿肠道感染，尤其是轮状病毒感染可以表现为蛋花样的稀水便，大便次数比较频繁，新生儿尿少甚至会出现脱水。如果是细菌感染导致的感染，可以表现为黏液脓血便，每次便量相对比较少。总之，新生儿肠道感染的症状和一般小孩感染的症状是极度相似的，关键是新生儿肠道感染病程进展比较快，如果治疗不及时，可能会发展成坏死性的小肠结肠炎，甚至会发生肠麻痹以及肠穿孔，最后可能需要手术治疗。
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